Theo TAND TP.Hải Phòng, từ năm 2003, đại gia Ngô Văn Phát (SN 1964 tại Thái Bình, hộ khẩu tại số 60 Trần Quang Khải, Q.Hồng Bàng, Hải Phòng; nơi ở tại số 9 Lê Hồng Phong, Đằng Hải, Hải An, Hải Phòng) đã thành lập Công ty cổ phần thương mại xăng dầu Phát (địa chỉ tại Nam Sơn, An Dương, Hải Phòng).
Sau nhiều lần thay đổi, Cty Xăng dầu Phát bổ nhiệm ông Vũ Xuân Bảy (SN 1950, quê Thái Bình, trú tại phường Đại Yên, TP.Hạ Long, Quảng Ninh) làm giám đốc; Nguyễn Thị Loan (SN 1989, trú tại P.Hồ Nam, Q.Lê Chân, Hải Phòng) làm kế toán trưởng; thuê Lương Văn Giao (SN 1991, trú tại xã An Lư, Thủy Nguyên, Hải Phòng) và một số người khác làm nhân viên công ty.
Trong thời gian từ tháng 3-2014 đến 8-2020, ông Ngô Văn Phát đã chỉ đạo Vũ Xuân Bảy, Nguyễn Thị Loan và Lương Văn Giao trực tiếp đứng ra thành lập, tuyển, thuê người đứng tên tổng cộng 22 doanh nghiệp "ma" để bán hóa đơn GTGT nhằm chiếm đoạt tiền thuế. 22 doanh nghiệp này tập trung ở địa bàn huyện Thủy Nguyên, Hải An, An Dương, Hồng Bàng, Ngô Quyền.
Để hoạt động bán hóa đơn được thuận lợi, tránh sự phát hiện của cơ quan chức năng, Ngô Xuân Phát đã chỉ đạo 3 cấp dưới nói trên tuyển người, thuê giám đốc công ty, đứng tên giám đốc công ty, phân công nhiệm vụ cụ thể cho từng người bán hóa đơn trái phép.
Theo phân công, Vũ Xuân Bảy được giao nhiệm vụ quán xuyến, chỉ đạo chung, phân công cho các đối tượng thành lập các công ty không có hoạt động sản xuất kinh doanh nhằm mục đích bán trái phép hóa đơn GTGT cho khách hàng; Nguyễn Thị Loan được giao điều hành các nhân viên tại văn phòng, quản lý công nợ tiền bán hóa đơn GTGT của các công ty ma, trực tiếp giao dịch với khách hàng, phân công người viết hóa đơn GTGT khống, thu tiền; Lương Văn Giao được giao nhiệm vụ trực tiếp đứng tên, thuê một số người làm giám đốc, ký khống các hợp đồng, hóa đơn, chứng từ khác...
Giao còn được Ngô Văn Phát đưa tiền mặt để chuyển cho một lãnh đạo Chi cục Thuế huyện Thủy Nguyên (Hải Phòng). Giao và người nhà đứng tên 11 - 22 công ty ma do Phát lập nên.
Theo tòa án, các đối tượng trên đã bán tổng số 25.125 hóa đơn GTGT với doanh số hàng hóa ghi khống lên đến 17.611 nghìn tỉ đồng. Những hóa đơn khống bán ra có giá từ 1 - 1,5% tổng số tiền được ghi khống trong hợp đồng mua bán hàng "ma". Các đối tượng đã viết hóa đơn GTGT khống cho tất cả các loại hàng hóa từ xăng dầu, vật liệu san lấp, vật liệu xây dựng... Tổng số tiền nhóm của Phát chiếm đoạt là hơn 173 tỉ tiền thuế GTGT.
Trong số tiền chiếm đoạt của Nhà nước, Ngô Văn Phát thu lời bất chính hơn 161 tỉ đồng, Vũ Xuân Bảy thu 900 triệu đồng, Nguyễn Thị Loan thu giữ 693 triệu đồng, Lương Văn Giao thu 460 triệu đồng, ba nhân viên còn lại gồm Trần Thị Hằng, Nguyễn Thị Thúy, Nguyễn Thị Hải Q. thu lời bất chính số tiền 446 triệu đồng.
Trong các ngày 27-8 đến 1-9-2020, Cơ quan CSĐT Công an huyện Thủy Nguyên (Hải Phòng) đã ra lệnh giữ, bắt người trong trường hợp khẩn cấp đối với các đối tượng Ngô Văn Phát, Vũ Xuân Bảy, Lương Văn Giao, Nguyễn Thị Loan, Mai Thị Nhài, Nguyễn Thị Thúy và Trần Thị Hằng về hành vi mua bán hóa đơn trái phép. Khám nhà của đại gia Phát "dầu" và các đối tượng nói trên, cơ quan công an đã thu giữ nhiều hóa đơn, chứng từ, hợp đồng mua bán, giấy tờ cá nhân... liên quan đến việc mua bán hóa đơn GTGT khống.
Theo nhận định của TAND TP.Hải Phòng, Ngô Văn Phát là người chủ mưu, cầm đầu, chỉ đạo toàn bộ hoạt động tội phạm, nên phải chịu phạt 24 tháng tù, yêu cầu Phát phải nộp lại số tiền đã thu lời bất chính. Do Phát đã nộp được hơn 26,5 tỉ khắc phục hậu quả, hiện vẫn còn hơn 135 tỉ nên biệt thự của Phát trên đường Lê Hồng Phong được kê biên để đảm bảo thi hành án.
Bị cáo Vũ Xuân Bảy và Nguyễn Thị Loan bị phạt 20 tháng tù; bị cáo Lương Xuân Giao bị phạt 18 tháng tù. Hai bị cáo Nguyễn Thị Thúy và Trần Thị Hằng bị phạt 12 tháng tù. Các bị cáo này bị phạt thêm từ 10-50 triệu đồng, đồng thời phải nộp lại các khoản tiền đã thu lời bất chính. Một số các đối tượng còn lại chỉ bị phạt tiền.
Theo TAND TP.Hải Phòng, việc Phát sử dụng hóa đơn GTGT từ các doanh nghiệp "ma" mình lập ra để hợp thức hóa số lượng xăng dầu cho chính Cty CP xăng dầu Phát để trốn 27 tỉ đồng tiền thuế. Phát có dấu hiệu vi phạm tội trốn thuế. Tuy nhiên, do ông ta đã chịu tình tiết định khung về tội "mua bán hóa đơn trái phép" nên không bị xem xét trách nhiệm hình sự tội trốn thuế. Riêng hai bị cáo Vũ Xuân Bảy và Nguyễn Thị Loan - đồng phạm tích cực của Phát trong vụ án này tiếp tục được Công an Hải Phòng khởi tố vụ án, khởi tố bị can để điều tra thêm tội "trốn thuế".
Đại gia Ngô Văn Phát là người nổi tiếng trong lĩnh vực kinh doanh xăng dầu, làm chủ nhiều công ty. Ở Hải Phòng, ông xây dựng tòa lâu đài cao ba tầng, rộng hàng nghìn mét vuông trên đường Lê Hồng Phong (quận Hải An). Còn ở Thái Bình, ông cũng xây một tòa nhà hoành tráng trên quê hương Tiền Hải.