(CAO) Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy bộ gene thu được của bệnh nhân ở thuộc biến chủng B.1.617.2, xuất hiện ở Ấn Độ.
Ngày 18/5/2021,TPHCM ghi nhận 02 trường hợp lây nhiễm trong cộng đồng, trong đó có BN4514 (ngụ tại Chung cư SunVeiw Town, TP.Thủ Đức). Kết quả giải trình tự gene cho thấy BN4514 nhiễm SARS-CoV biến chủng Ấn Độ B.1.617.2.
Công ty nơi hai ca nhiễm ở TPHCM làm việc
Theo thông tin báo cáo, nhóm nghiên cứu COVID-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt Đới và Đơn vị Nghiên cứu Lâm Sàng Đại Học Oxford, từ mẫu bệnh phẩm ngày 18/5 của BN4514 đã thu nhận được 01 bộ gene SARS-CoV-2 từ 01 mẫu RNA đưa vào phân tích. Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy bộ gene thu được thuộc biến chủng B.1.617.2. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy, bộ gene mang 6 đột biến thay đổi aminoacid tiêu biểu (T19R, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N) và một đột biến đứt đoạn (156-158) trên vùng protein gai của biến chủng B.1.617.2. Qua đó kết luận BN4514 nhiễm SARS-CoV-2 biến chủng Ấn Độ B.1.617.2, cùng chủng đang lưu hành hiện nay tại các tỉnh phía Bắc Việt Nam.
Liên quan đến BN 4514 còn có trường hợp nhiễm đã được xác định (đang đợi Bộ Y tế công bố) ngụ tại quận 7. Hai người cùng làm việc chung trong một đội 8 người tại một phòng làm việc trong công ty Grove, đường Pasteur, ở quận 3.
Bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7, theo lời khai, đã rời khỏi TP.HCM từ ngày 24/4 đi Hải Phòng và trở về lại ngày 5/5 trên chuyến bay đi VN1179 từ Hải Phòng đến TP.HCM. Bệnh nhân có dấu hiệu sốt, tự mua thuốc uống vào ngày 8/5. Căn cứ kết quả dấu hiệu lâm sàng, yếu tố dịch tễ và xét nghiệm thì có nhiều chứng cứ cho thấy BN 4514 bị lây từ bệnh nhân cư ngụ tại Quận 7. Tuy nhiên, đối với trường hợp bệnh nhân ở quận 7, do tình trạng bệnh đang quá trình hồi phục nên rất khó để thực hiện giải trình tự gene. Nhưng nhóm nghiên cứu sẽ cố gắng hết sức để có thể giải trình tự bộ gen của SARS-CoV trên bệnh nhân này.
* Cũng trong trưa nay, Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ương công bố kết quả giải trình tự gene các mẫu do các địa phương gửi về ở những bệnh nhân đã mắc COVID-19.
Kết quả giải trình tự gene các mẫu ngày 19/5/2021 do các tỉnh gửi về như sau:
- 29 mẫu thuộc biến thể B.1.617.2 thuộc biến chủng lần đầu tiên được tìm thấy ở Ấn Độ, trong đó tại: Hà Nội (10), Bệnh viện K (5), Bắc Giang (9), Bắc Ninh (2), Vĩnh Phúc (2), Hải Phòng (1).
- 02 mẫu thuộc biến thể B.1.1.7 thuộc biến chủng của Anh tại Hải Dương.